Большую часть жизни Таниказэ Нагатэ, принадлежащий в населению исполинского космического корабля «Сидония», несущего в себе остатки человеческой расы, провел в лабиринте подземных коридоров. Плохо знакомый с порядками и нравами людей, населяющих «Сидонию», он хорошо умел лишь одно. Пилотировать старую модель летательных аппаратов-стражей, созданных для защиты корабля от ужасного врага – гигантских и непостижимых гаун, которые когда-то напали на Землю, и теперь преследуют человечество и в космосе.
Став одним из пилотов-защитников Сидонии, Таниказэ многое узнал о самом себе и окружающем мире, а ученые с его помощью смогли получить материал для изучения гаун. После того, как было отражено немало их атак, и множество пилотов погибло, Таниказэ и его близкие товарищи стали единственной надеждой «Сидонии» на благополучный исход длительного путешествия. Впрочем, впереди лежит еще очень долгая дорога, ведь многое до сих пор неясно. Почему гаун притягивает к «Сидонии» единственное оружие, способное их победить? Могут ли они и люди понять друг друга? И, наконец, какие еще мрачные тайны скрывают ученые и правители «Сидонии», управляющие кораблем вот уже много веков?
